Черепашки-ниндзя

Четыре ниндзя в панцирях больше не совершают совместных подвигов, после победы над Шреддером у них не осталось общих целей. Леонардо продолжает совершенствовать своё боевое искусство вдали от друзей где-то в джунглях Центральной Америки, Микеланджело и Донателло занялись мелким бизнесом. Лишь один Рафаэль до сих пор играет роль супергероя, скрываясь под маской Ночного Всевидящего. Эйприл навещает Лео и просит его вернуться назад, но тот ничего не добился и не хочет раскрывать близким правду о своём состоянии.

В Нью-Йорке тем временем начинают происходить странные события – объявляются тринадцать древних монстров, которые способны нанести огромный ущерб человечеству. Испытывая стыд перед учителем, Лео всё же возвращается в родной город ни с чем. Он объединяется с братьями, чтобы вновь бороться с преступностью и противостоять новому злу. Но сначала им нужно преодолеть разногласия, а старый Сплинтер требует, чтобы они как прежде стали одним целым.